Penelitian ini dilatar belakangi oleh adanya lembaga pendidikan yang memiliki keberagaman peserta didik dalam menghadapi perbedaan agama yang menjadi realita dalam kehidupan. Penelitian ini menarik untuk diuji karena melihat banyak sekali tantangan yang terjadi pada remaja terutama sikap dalam menghadapi perbedaan agama dalam kehidupan sekolah umum dan dalam hal ini, seorang guru memegang peranan yang sangat penting dalam melaksanakan proses pembelajaran. Fokus penelitian dalam skripsi ini adalah: (1) Bagaimana strategi guru Pendidikan Agama Islam dalam menumbuhkan sikap toleransi pada peserta didik minoritas muslim di SMP Negeri 1 Pupuan Tabanan? (2) Apa saja faktor pendukung dan penghambat strategi guru Pendidikan Agama Islam dalam menumbuhkan sikap toleransi pada peserta didik mioritas muslim di SMP Negeri 1 Pupuan Tabanan?. Penelitian ini menggunakan penelitan kualitatif dengan jenis lapangan. Dalam pengumpulan data menggunakan observasi, dokumentasi dan wawancara. Dengan metode-metode tersebut diharapkan dapat memperoleh data-data yang relevan yang sesuai dengan kebutuhan dalam penelitian yang dilaksanakan di SMP Negeri 1 Pupuan. Setelah data terkumpul kemudian dianalisa melalui metode deskriptif kualitatif. Dari hasil penelitian yang dilakukan peneliti menunukkan bahwa : (1) Strategi guru PAI dalam menumbuhkan sikap toleransi beragama pada siswa minoritas muslim yaitu terdapat strategi didalam kelas yang terdiri dari pendidikan karakter, pengajaran konten yang relevan yang berkaitan dengan materi toleransi dan strategi diluar kelas yang terdiri dari keteladanan dan pembiasaan. (2) Faktor pendukung dan penghambat strategi guru PAI dalam menumbuhkan sikap toleransi beragama pada peserta didik minoritas muslim yaitu dukungan institusional, toleransi antar umat beragama kerjasama dengan orangtua dan masyarakat serta sarana dan prasarana yang tersedia. Sedangkan faktor penghambat strategi guru pendidikan agama Islam adalah keterbatasan waktu dan kesadaran serta faktor lingkungan.